重庆市传染病医院又称（重庆市公共卫生医疗救治中心）是重庆市唯一的三级传染病专科医院，是重庆市十大公共卫生中心之一，是重庆市传染病诊断及治疗最权威的机构，是重庆市结核病、耐多药结核病、艾滋病治疗定点医院，同时是重庆市结核病医疗质量控制中心、重庆市艾滋病医疗质量控制中心、重庆市呼吸道传染病医疗质量控制中心、重庆市卫生局艾滋病防治协调小组医疗组办公室、中国肝炎研究中心临床基地。 “中心”始建于1943年，前身是陪都肺病疗养院，后历经重庆市结核病防治院、重庆市结核病医院、重庆市胸科医院，于2008年与建于1945年的原重庆市传染病医院合并成为重庆市公共卫生医疗救治中心。

重庆市传染病医院坐落于长江上游科教文化名区——重庆市沙坪坝区。总占地面积约140余亩，固定资产4亿多元，开放病床800余张（2018年将达1000张）。现有职工800人，其中专业技术人员近600人，中级职称以上300余人，高级职称82人，博士2名，硕士50名。主要拥有东芝16排CT、1.5T医用磁共振成像系统、全数字彩色多普勒超声诊断系统、超高清电子支气管镜、电子胃肠镜、电子胸腔镜、腹腔镜、美国Cepheid 全自动医用PCR分析系统、BD960全自动分枝杆菌培养监测系统等医疗设备。 “中心”设有两个院区，歌乐山院区毗邻空气清新、风景秀美的歌乐山森林公园，主要承担传染病医疗救治任务和公共卫生传染病应急工作，在结核病和艾滋病的诊断治疗上有先进的技术水平，拥有全国知名专家和先进的各种仪器设备，可快速确诊并有效治疗结核病及艾滋病。

重庆市传染病医院开设科室有：结核内科、感染科、普内科、胸外科、手术麻醉科、急诊科、重症医学科、中医科、药剂科、检验科、放射科、特检科及供应室等；平顶山院区交通便利，邻接小龙坎平顶山森林公园，主要承担综合性医疗救治任务，开设科室有：急诊科、肝病消化科、肾内内分泌科、呼吸老年科、心内神内科、普外泌尿康复科、妇产科、重症医学科、手麻科以及药剂科、检验科、放射科、特检科等。 “中心”集医、教、研、防为一体，是重庆市“传染病学重点学科”建设单位、国家中医药管理局 “中医药防治传染病重点研究室” （临床基地）、中华传染病医院管理学会副理事长单位。先后主持并参与 “十一五”、“十二五”国家科技重大专项7项，市科委及重庆市卫生计生委各类立项科研项目40余项。近年来，“中心”先后与美国霍尔普金斯医学院感染病医院、美国艾滋病健康教育基金会（AHF）、复旦大学附属上海肺科医院、华山医院，首都医科大学附属北京胸科医院、北京地坛医院、北京佑安医院以及第三军医大学西南医院等科研院所及医疗机构建立了长期、友好合作关系。科研实力逐年提升。