焉耆县人民医院始建于1952年12月，是一所集医疗、教学、预防保健、康复、急救、社区卫生服务为一体的综合性二级甲等医院，系河北医科大学第二、第三附属医院、新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院技术协作医院，四川大学华西医院、新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院远程会诊教学定点医院，新疆医科大学、甘肃平凉医专、巴州卫校教学实习医院。
焉耆县人民医院目前已自行开展腹腔镜下行胆囊、阑尾切除术、小儿疝疝口关闭术、卵巢囊肿剥除术、异位妊娠病灶切除术、开创术，宫腔镜、关节镜、鼻窦镜手术，经输尿管镜气压弹道碎石术、前列腺气化电切术、胆肠吻合术、肝硬化门脉高压脾切除血管离断术、脊柱关节手术、颅内血肿立体定向钻孔引流术、白内障超声乳化+人工晶体植入术等疑难复杂手术。内科系统在心血管、肾病、内分泌、消化系统等疾病诊疗方面已积累了一定的临床经验。
医院先后获得自治区级文明单位、卫生红旗单位、无烟先进单位、自治州级五佳医院、医院管理先进单位、花园式单位、继续医学教育先进单位、助残先进单位、自治州文化卫生发展年先进集体、自治州级模范职工之家、自治州卫生系统医院管理工作先进单位、安康杯技能竞赛先进单位、自治县行风评议优秀单位、社会治安综合治理先进单位等荣誉称号！
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